제약업체들이 약가인하로 인해 매출 감소를 상쇄하기 위해 다국적제약사의 오리지널 의약품 도입에 적극 나서고 있지만 이는 오히려 국내 제약산업의 체질을 취약하게 만드는 요인이 될수 있다는 지적이다.

최근 매출 상위권 모 제약사는 투자자들의 이해를 돕기 위해 제공한 '투자위험 알림문'을 통해 제약산업에 대한 투자 위험 요소를 일일히 열거해 주목을 끌고 있다.

이 투자 위험문에 따르면 약가인하로 인한 매출 감소를 상쇄하기 위해 국내 제약사들이 다국적 제약사의 오리지널 의약품을 도입해 판매하는 경우가 증가하고 있다며, 이러한 품목 도입은 대체로 마진이 낮고 불공정 거래 조건도 많을 수 있어 국내 제약산업의 체칠을 취약하게 만든다고 우려했다.

또 2009년 하반기 이후 정부가 도입한 '리베이트-약가인하 연동제'와 '쌍벌제' 등으로 인해 국내 제약업체의 성장세가 둔화되는 결과를 낳았고 매출과 수익성 측면에서 부정적인 영향으로 인해 향후 제약산업의 구조조정 가능성이 있다고 전망했다. 

이와 함께 2012년 6월 총 43개의 제약사가 혁신형 제약기업으로 선정돼 국가 R&D 사업 우선 참여, 세제 지원 혜택, 약가 결정시 우대 등의 혜택이 부여될 계획이지만 중상위권 제약사 대부분이 혁신형 제약기업으로 선정된 만큼 각 사에 돌아간 혜택은 현재까지는 미미한 수준이라고 지적했다.

투자위험문은  한미FTA가 2012년 3월 15일 발효돼 우리나라는 2007년 합의된 한미 FTA 협정문에 따라 이행 의무 유예기간 3년 후 '의약품 허가-특허 연계제도'를 도입하여야 한다며, '의약품 허가-특허 연계제도' 도입으로 인한 신약 특허권 강화로 인해 단기적으로 국내 제약산업의 매출액이 감소할 것으로 예측했다.

특히 정부가 비대해진 의약품비로 인해 건강보험 재정건전성이 위협받고 있는 상황을 고려해 2006년 '약제비 적정화방안'을 시작으로 제약산업 선진화를 추진하고 있으며. 앞으로도 의약품비에 대한 정부의 약가인하 압력은 지속될 것으로 예상돼 제약업체들에 부정적인 영향을 미칠 수 있다는 우려감을 표명했다.