김응돈 교수는 ‘급성기 대상포진 및 대상포진 후 신경통에서 후근신경절에 대한 박동성 고주파의 효과’, ‘복합부위통증증후군 환자에서 지속적 흉부교감신경차단의 효과’, ‘새로 고안한 변형된 요추 경막외 신경차단법의 효과’ 등 대상포진 및 난치성 신경병증인 복합부위 통증증후군, 척추신경치료 등에 관한 논문 다수를 국내외 유명 저널에 게재했다.  

또 대한마취통증학회 정회원, 대한통증학회 정회원, 대한척추통증학회 정회원, 대한통증학회 학술위원회 간사, 대한통증학회 정보위원회 위원 등 활발한 대외활동을 통해 통증의학을 알리는데도 힘쓰고 있다.