IV리서치는 프로티나가 인공지능(AI) 신약개발의 핵심 병목으로 꼽히는 실제 실험 검증(Wet-Lab) 역량을 기반으로 AI 바이오파운드리(Biofoundry) 서비스 시장에 진출하고 있다고 밝혔다. 투자의견과 목표주가는 제시하지 않았다.

IV리서치는 2일 프로티나 관련 보고서를 통해  "프로티나의 사업모델은 단백질상호작용(PPI) 랜드스케이프(Landscape) 기반 신약개발과 PPI 패스파인더(PathFinder) 기반 임상 검체 분석"이라고 밝혔다. PPI Landscape는 단일분자 단백질 상호분석(SPID) 플랫폼을 활용해 항체 후보물질의 주요 특성을 대규모로 측정하고 후보물질을 최적화하는 사업이다.

프로티나는 삼성바이오에피스와 공동개발 및 기술이전 옵션 계약을 체결해 평가를 진행 중이다. 자체 파이프라인으로는 골관절염 치료제 PRT-101과 비만·대사질환 치료제 PRT-1309를 개발하고 있다.

PPI PathFinder는 실제 환자의 임상 검체에서 단백질 간 상호작용 변화를 측정해 바이오마커를 개발·검증하는 사업이다. 현재 비세포림프종2(BCL-2) 혈액암 바이오마커 분석·검증 서비스를 수행하고 있으며 염증성 질환과 뇌질환 바이오마커로 적용 범위를 넓히고 있다.

프로티나는 이 같은 역량을 기반으로 AI가 설계한 대량의 항체 후보물질을 실제 실험으로 검증하는 AI 바이오파운드리 서비스로 사업 영역을 넓히고 있다. 최근 단백질 구조와 항원·항체 결합을 예측하는 AI 모델이 잇따라 등장하면서 후보서열 설계의 진입장벽은 낮아졌지만 실제 의약품 개발에 필요한 생산성·안정성·응집 가능성 등은 실험을 통한 검증이 필요하다.

IV리서치는 "실제 의약품 개발에 필요한 개발적합성(developability) 특성은 학습 데이터가 부족해 예측 정확성이 낮아 AI 신약개발의 핵심 병목은 웨트랩이 될 것"이라고 설명했다.

프로티나는 기존 PPI Landscape 사업에서 구축한 후보물질 생성·발현, 결합력 및 생산성 평가, 후보 선별 프로세스를 외부 고객에게 서비스 형태로 제공할 계획이다. 현재 월 약 4만건 수준인 분석 캐파(CAPA)를 2028년 월 100만건까지 확대할 예정이다.

이어 "트위스트바이오사이언스(Twist Bioscience)와의 협력은 AI 바이오파운드리 사업 초기 사례가 될 것"이라고 분석했다.